肺纤维化相关的细胞间通讯网络研究

摘要：

目的 建立肺纤维化相关的细胞间通讯网络,并探究细胞间通讯网络在肺纤维化中的作用.方法 基于公开的肺纤维化单细胞测序数据和配体-受体相互作用数据库,并基于自助抽样的新算法建立肺纤维化相关的细胞间相互作用网络;使用Circos和Cytoscape软件对细胞间通讯网络进行可视化,并进一步分析其对细胞功能通路的影响.结果 首先,建立了肺纤维化相关的肌成纤维细胞、成纤维细胞、脂成纤维细胞、间充质祖细胞、间皮细胞、内皮细胞和高表达Pdgfrb的间充质细胞之间的通讯网络模型.然后,筛选出各种细胞类群中与肺纤维化显著相关的配体-受体关系对,并重点研究了几个与肺纤维化有关的配体或受体.最后,分析了与细胞间通讯网络相关的细胞功能通路.结论 该研究基于单细胞转录组测序数据利用自助抽样算法,建立了肺纤维化相关的细胞间通讯网络,并初步揭示了与肺纤维化相关的显著高表达的配体、受体及其影响的功能通路.

关键词：肺纤维化;间充质细胞;单细胞转录组测序;细胞间通讯网络

所属期刊栏目：45

分类号：R563.9(呼吸系及胸部疾病)

资助基金：国家自然科学基金;北京市科技新星计划

在线出版日期：2021-11-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：590-597