新型冠状病毒种内变异及进化研究

摘要：

目的 新型冠状病毒疫情在全球传播,了解其变异进化规律,为疫情防控提供参考.方法 选取公共数据库中的新型冠状病毒全基因组序列,采用生物信息学方法 ,对病毒基因组进行系统发育和氨基酸突变位点分析.结果 系统发育分析显示,子簇1和2包含多个国家和地区的毒株,子簇3以我国东南沿海地区毒株为主,子簇4为欧洲地区毒株.发现新型冠状病毒存在25个稳定突变位点,其中位于orf8:84、orf3a:251、orf1ab:3607、orf1ab:4714和S:613与全基因组进化分成的4个分支具有密切联系.其余突变位点与进化树进一步分簇相关,具有形成稳定克隆的潜力,可能成为新的流行株.结论 稳定变异有助于新型冠状病毒传播过程中的适应性进化,种内变异的发现有助于了解病毒的演化方向和流行趋势,为新型冠状病毒监测和溯源提供参考依据.但这些稳定变异位点对病毒的传播和致病能力影响尚未得知,亟需更多分子生物学方面的深入研究.

关键词：新型冠状病毒、全基因组进化、氨基酸变异

所属期刊栏目：44

分类号：R373.19(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家科技重大专项;新冠肺炎疫情防控应急攻关专项任务

在线出版日期：2020-07-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：241-245