利用CRISPR/Cas9全基因组文库筛选HCT116细胞增殖相关基因

摘要：

目的 利用CRISPR/Cas9全基因组文库大规模筛选与细胞增殖相关的基因.方法 将HCT 116细胞大规模培养至1 ×108个,将CRISPR/Cas9全基因组慢病毒文库大规模感染,加入嘌呤霉素筛选6d后收集部分细胞,剩余细胞继续培养10d,收取全部细胞,提取基因组DNA,扩增单链向导RNA (sgRNA)序列、建库并进行深度测序,比较前后两组sgRNA序列数据,根据sgRNA序列数量筛选出与细胞增殖相关的基因.结果 与结论 筛选出了一批与HCT 116细胞增殖相关的蛋白编码基因及miRNA基因,获得了增殖相关miRNA及其靶基因的调控网络,为进一步验证分析这些基因在HCT 116细胞中的功能奠定了基础.

关键词：CRISPR/Cas9全基因组文库、高通量测序、细胞增殖、基因组、HCT 116细胞、微RNA

所属期刊栏目：42

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金资助项目81773038,91540202

在线出版日期：2019-05-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：822-827