嗜麦芽窄食单胞菌外膜蛋白OmpA的生物信息学分析

摘要：

目的 对嗜麦芽窄食单胞菌外膜蛋白A(OmpA)的结构和功能进行预测与分析.方法 利用生物信息学软件和生物数据库对OmpA蛋白的理化性质、信号肽、跨膜区、亚细胞定位、二级与三级结构、同源性、保守结构域及抗原决定簇进行预测分析.结果 OmpA蛋白为亲水性蛋白,其1~22位氨基酸为信号肽序列,无跨膜结构并定位于细胞膜外;二级结构中含无规则卷曲、α-螺旋、β-转角和 β-片层比例分别为50.27%、24.59%、9.29%和15.85%;三级结构预测OmpA蛋白为桶状蛋白;OmpA蛋白在不同嗜麦芽窄食单胞菌株间高度保守,而与人、小鼠的蛋白序列进行比对分析未找到同源序列;OmpA蛋白保守结构域在N端为OM膜通道蛋白超家族,在C端为OmpA_C超家族;OmpA蛋白含有11个优势抗原决定簇区域.结论 通过对OmpA进行生物信息学分析获得该蛋白的特性,不仅为进一步研究该蛋白的结构与功能提供参考资料,也为研制相关亚单位疫苗提供理论依据.

关键词：嗜麦芽窄食单胞菌、外膜蛋白A、生物信息学、结构、功能、抗原决定簇

所属期刊栏目：41

分类号：R378(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金资助项目81571959,81071399

在线出版日期：2018-05-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：987-990