大肠杆菌基因组水平蛋白质-RNA相互作用初步研究

摘要：

目的：初步研究大肠杆菌中基因组水平的蛋白质-RNA相互作用（ protein-RNA interactions，PRI）。方法通过RNA酶消化细菌裂解液，提取与蛋白质相互作用的RNA片段，构建cDNA文库，进行高通量测序，并通过生物信息学分析获得与蛋白质结合的转录本。结果获得了与蛋白质结合的3193条转录本，涉及2234个mRNA、47个sRNA（small regulatory RNAs）、39个tRNA、11个rRNA以及862个基因间区（intergenic region， IGR）。结论初步获得大肠杆菌中与蛋白质相互作用的转录本信息，为进一步开展PRI研究提供了支持。

关键词：蛋白质-RNA相互作用、sRNA、大肠杆菌、MCA

分类号：Q75;R341(分子遗传学)

资助基金：国家973计划资助项目2010CB912801；国家自然科学基金资助项目31271404，31071157

在线出版日期：2014-10-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：612-616