10.3969/j.issn.1674-9960.2012.09.005
1株保存的马雅罗病毒基因组序列测定及分析
目的 对保存的WJBC株马雅罗病毒(MAYV)基因组序列进行测定,阐明其与已报道毒株的关系及追溯其可能来源.方法 将MAYV基因组编码区分10段进行RT-PCR扩增,扩增产物直接进行测序,非编码区采用RACE法进行扩增,扩增产物纯化并连接pGEM-T easy载体后转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,挑取阳性克隆鉴定后进行测序,用DNAStar软件将测序结果拼接得到基因组序列.下载MAYV核苷酸序列,利用MEGA5.0软件构建系统进化发生树.结果与结论 WJBC株MAYV基因组核苷酸(nt)共11429 nt,编码3679个氨基酸,其中5’端的2/3基因组编码4种非结构蛋白nsP1,nsP2,nsP3,nsP4;3’端的1/3基因组编码5种结构蛋白C、E3、E2、6K和E1蛋白.结构基因和非结构基因之间有26 nt的连接区为非翻译区.病毒基因组5’端和3’端分别有76、290 nt的非编码区.进化树结果显示,WJBC株马雅罗病毒与TRVL4675株MAYV亲缘性最高.
马雅罗病毒、基因组、逆转录聚合酶链反应
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R373.9(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))
2012-11-28(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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