BioSunLAMP:一个用于环介导等温扩增的引物设计软件

摘要：

目的 环介导等温扩增法(1oop-mediated isothermal amplification,LAMP)是一种新型等温核酸扩增方法.由于其具有简便、高效、特异性高和成本低等优点,在甲型HlNl流感和肺结核等流行病检测中得到了广泛应用.在LAMP技术中,关键的起始步骤是设计合适的引物序列.为了让引物设计更加方便与高效,我们开发了LAMP引物设计软件BioSunLAMP.方法 采用Delphi程序设计语言开发了界面友好、便于使用的软件系统.结果 经甲型HlNl流感、结核分枝杆茵实验验证,BioSunLAMP软件设计的引物达到了预期效果.此外,与同类软件相比,BioSunLAMP还具有如下特点:①集引物设计与引物特异性分析于一体,可以通过本地数据库或远程调用NCBI的相关数据库来检查引物特异性;②支持针对多序列的通用引物与特异引物设计.结论 BioSunLAMP软件的开发,为LAMP技术的普及提供了很好的生物信息学支持.

关键词：BioSunLAMP、LAMP、引物设计

所属期刊栏目：36

分类号：TF31(冶金机械、冶金生产自动化)

资助基金：国家自然科学基金资助项目31071157

在线出版日期：2012-05-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：230-233