广西首例HIV-1G亚型毒株的发现和近似全长基因组序列分析

摘要：

目的 获得广西首例HIV-1G亚型毒株全长基因组序列并分析其来源.方法 采集1例广西HIV感染者血浆,提取病毒RNA,利用逆转录巢式-PCR技术,分两段扩增病毒近似全长基因序列,对PCR产物进行核苷酸序列测定,利用MEGA软件对全长序列进行系统进化分析.结果 获得了8800 bp长度的近似全长基因组序列,系统发育分析结果显示该毒株与HV-1G亚型参考株成簇,Bootstrap值为99%,通过与世界上其他地区流行的HIV-1G亚型毒株进行亲缘分析,该毒株与喀麦隆流行毒株的关系最近.结论 在广西发现了首例HIV-1G亚型感染者,推测该毒株是由境外传入的,应对广西地区流行的HIV-1毒株的来源和变异进行密切监测.

关键词：G亚型、HIV-1、近似全长序列、系统进化树分析、基因组

所属期刊栏目：36

分类号：R512.91(传染病)

资助基金：国家"十一五"科技重大专项资助项目2008ZXl0001.004

在线出版日期：2012-05-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：192-195