Liverbase:人类肝脏蛋白质组数据库应用系统的研发

摘要：

目的 人类肝脏蛋白质组计划(HLPP)的顺利实施产出了大量的肝脏蛋白质组数据,这也是迄今最大的人类组织器官的蛋白质组数据.为帮助科学家方便有效地利用这些数据,我们开发了人类肝脏蛋白质组数据库Liverbase.方法 Liverbase 基于MySQL、JSP、JavaBean和JDBC等技术而开发.主要针对数据库系统结构、数据处理及注释、数据库系统功能及使用三方面展开并进行详细的阐述.结果 Liverbase的主要功能是展示、管理和检索人类肝脏蛋白质组计划鉴定到的蛋白质及其功能注释信息.对每个鉴定到的蛋白质提供了全面的注释信息,整合了mRNA/蛋白质丰度信息.结论 Liverbase具有简捷实用、易于查询和访问、可扩展性好以及便于维护等特点.数据库的访问地址是http://liverbase.hupo.org.cn.

关键词：肝脏、数据库、蛋白质组、转录组、蛋白质注释

所属期刊栏目：34

分类号：Q51(蛋白质)

资助基金：国家重点基础研究发展计划973计划项目2006CB910803,2006CB910706,2010CB912700;国家高技术研究发展计划863计划2006AA02A312;国家科技重大专项2008ZX10002-016,2009ZX09301-002;国家自然科学基金30800200, 30621063;蛋白质组学国家重点实验室课题SKLP-Y200811

在线出版日期：2010-09-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：201-205