丹系大白母猪背膘厚性状的全基因组关联分析

摘要：

背膘厚影响生猪育肥效果、脂肪沉积能力及母猪繁殖性能,是大白猪选育的重要指标之一.为寻找与丹系大白母猪背膘厚性状相关的分子标记,利用55K SNP芯片对695头大白母猪群体进行基因分型,并对背膘厚性状进行全基因组关联分析(GWAS),筛选显著影响背膘厚性状的单核苷酸多态性(SNP)位点及候选基因.结果表明:丹系大白母猪平均背膘厚为9.33 mm,经质控后共获得64 812个SNP位点,GW AS分析筛选出2个与背膘厚显著相关的SNPs(rs332580652、rs336799903);群体遗传多样性分析显示,仅rs336799903多态性分布处于Hardy-Weinberg平衡,且该位点在丹系大白猪群体中呈中度多态;对关联显著的SNPs上下游200 kb内编码基因进行筛查,共发现4个候选基因(ENSSSCG00000021336、THEG,ENSSSCG00000020950、ENSSSCG00000026639);对关联显著的 SNPs 与染色质修饰关系进行注释,发现rs332580652仅仅在肝脏组织中存在H3K27me3修饰,而rs336799903在猪的不同组织中存在H3K27me3和ATAC修饰.综上,利用GW AS筛选出丹系大白母猪背膘厚相关SNPs及候选基因,为后续通过分子育种手段降低丹系大白母猪背膘厚进而改善猪肉品质,为生猪绿色健康养殖提供一定的理论依据和借鉴.

关键词：大白猪、背膘厚、全基因组关联分析、SNP、候选基因

所属期刊栏目：43

分类号：S828.3(家畜)

资助基金：江苏省农业科技自主创新资金项目;江苏省种业振兴揭榜挂帅项目

在线出版日期：2023-03-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：60-66