开产前和产蛋高峰期泰州鹅卵巢转录组SNP分析

摘要：

为探究泰州鹅繁殖相关差异基因SNP位点,研究开产前和产蛋高峰期泰州鹅卵巢组织转录组水平基因表达变化.通过Illumina HiSeq2500高通量测序分析3只开产前(10周龄)和3只产蛋高峰期(40周龄)泰州鹅卵巢组织转录组表达差异;结合参考基因组对所获得的序列比对、基因注释和差异表达等分析,筛选与泰州鹅产蛋性能相关基因SNP位点;通过氨基酸序列比对,进一步筛选引起氨基酸改变的SNP位点.结果表明:共获得1 743个差异表达基因,其中上调表达基因898个,下调表达基因845个.这些差异基因在6只泰州鹅卵巢中分别检测出73 776～804 748个SNP位点,这些位点分布在内含子区域的最多,且转换类型总数(A-G和C-T)发生频率最高.结合文献报道,筛选出与繁殖性能相关的7个候选差异表达基因,包括SLIT2、GDF9、RAPGEF6、GATA3、FSHR、AMH和GGA2,这些基因在开产前和产蛋高峰期泰州鹅卵巢组织中共检测出20个SNP位点引起了氨基酸的改变.这一研究为泰州鹅繁殖性能相关候选基因筛选提供了理论依据.

关键词：泰州鹅、转录组测序、卵巢、繁殖性能、SNP

所属期刊栏目：43

分类号：S835.2(家禽)

资助基金：江苏省农业科技自主创新资金项目;泰州市科技支撑计划农业项目

在线出版日期：2022-11-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：36-44