辣椒疫霉EST-SSRs标记的发掘

摘要：

通过对GenBank上发布的55 848条辣椒疫霉EST的鉴定,在328条EST中发现331个SSR.在筛选的EST序列中SSR平均密度为每23.7 kb含有1个SSR.在鉴定的SSR中,三核苷酸重复基元的SSR类型最多,占鉴定总数的59.5%;其次为二核苷酸乖复基元的SSR类型,为39.3%;四核苷酸重复基元的SSR类型最少,为1.2%.设计40对SSR引物对5个辣椒疫霉菌株基因组DNA进行PCR扩增,有27对引物扩增出SSR特征条带,其中有18对引物在5个辣椒疫霉菌株间扩增出多态性条带25条.基于SSR标记进行聚类分析,可将5个检测大豆疫霉菌菌株划分为3类.该研究是辣椒疫霉的SSR标记开发的首次报道,为辣椒疫霉的遗传变异和分子作图等分析提供了一种有效的分子标记系统.

关键词：辣椒疫霉、表达序列标签、SSR标记

所属期刊栏目：30

分类号：S436.418.1+9(病虫害及其防治)

资助基金：国家自然科学基金资助项目30800040

在线出版日期：2009-09-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：69-75