边鸡快长型与慢长型品系胚胎骨骼肌发育中差异可变剪切

摘要：

骨骼肌生长发育对肉鸡产业至关重要,可变剪切(AS)作为生物体内一种普遍存在的调控机制,在骨骼肌发育过程中发挥着重要作用.本研究以快长型、慢长型边鸡品系为试验材料,收集受精蛋后孵化至14胚龄和20胚龄,然后采集鸡胚腿肌进行转录组测序,用于分析骨骼肌发育过程中的差异可变剪切事件.在14胚龄慢长型(S14)与14胚龄快长型(F14)比较组中共发生230个差异可变剪切事件,其对应了200个基因,在20胚龄慢长型(S20)与20胚龄快长型(F20)比较组中共发生373个差异可变剪切事件,其对应了324个基因,且2个比较组中存在47个相同的基因.GO富集分析结果表明,前20个富集条目中包括丝氨酸家族氨基酸分解代谢过程、肌球蛋白II细丝组装和肌动球蛋白结构组织等与骨骼肌发育相关的生物学过程.KEGG通路富集分析结果表明,前20条通路中有多条通路与骨骼肌发育相关,包括黏附连接、肌动蛋白细胞骨架调节和黏着斑等.基于STRING数据库对所有差异可变剪切事件的来源基因进行蛋白质互作网络分析,然后利用Cytoscape(3.8.2)软件中的插件CytoHubba筛选核心基因,结合富集分析结果在S14与F14比较组中发现TLN2、PARVB和ITGA6等多个关键候选基因,在S20与F20比较组中发现LDB3、PDLIM3、ITGB5、DMD、TNS3和RAC1等多个关键候选基因,同时,筛选到的PDLIM5和GIT1候选基因在14胚龄、20胚龄边鸡骨骼肌发育中均发挥重要作用.本研究结果为进一步解析骨骼肌发育调控机理奠定了基础,也为黄羽肉鸡的选育工作提供一定参考.

关键词：骨骼肌、可变剪切、鸡

所属期刊栏目：39

分类号：S831.2(家禽)

资助基金：山西省重点研发项目;生物育种工程项目;国家肉鸡产业技术体系项目;江苏高校优势学科建设工程项目;山西省现代农业产业技术体系建设专项资金资助项目

在线出版日期：2023-05-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：444-452