安卡拉病毒贵州分离株Fiber2基因的克隆及序列分析

摘要：

Fiber2蛋白是禽腺病毒血清4型(FAdV-4,又称安卡拉病毒)重要的免疫原蛋白,为深入了解FAdV-4贵州株Fiber2基因的遗传变异情况,本研究利用PCR技术扩增FAdV-4贵州晴隆株(GZ-QL)Fiber2基因,胶回收后将其连接至pMD19-T载体,转化入DH5α筛选阳性克隆质粒,经质粒PCR及双酶切鉴定后进行DNA测序,然后对测序结果进行生物信息学分析.结果显示,GZ-QL株Fiber2基因全长为1440 bp,与四川分离的SCnj1601强毒株、北京分离的NIVD2强毒株Fiber2基因核苷酸同源性均为100.0％,与FAdV-4经典ON1株Fiber2基因核苷酸同源性为95.9％,两者位于相同进化分支.GZ-QL Fiber2蛋白共有33个氨基酸突变位点,其中,在第11～15位之间有5个氨基酸插入;蛋白质亲水性平均值为-0.031,其二级结构以无规则卷曲为主(占51.8％),无跨膜结构域或信号肽,抗原表位分布均匀,预测有8个优势抗原表位区域,且集中于N端.以上结果表明,FAdV-4贵州株GZ-QL Fi-ber2蛋白在禽腺病毒血清4型内相对保守且抗原性良好,具备成为优势抗原的潜力.

关键词：禽腺病毒血清4型、Fiber2基因、生物信息学分析

所属期刊栏目：38

分类号：Q785(基因工程（遗传工程）)

资助基金：贵州省科技计划项目;贵州省科技支撑计划项目;贵州省优秀青年科技人才项目

在线出版日期：2023-02-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1603-1611