10.3969/j.issn.1000-4440.2022.06.019
安卡拉病毒贵州分离株Fiber2基因的克隆及序列分析
Fiber2蛋白是禽腺病毒血清4型(FAdV-4,又称安卡拉病毒)重要的免疫原蛋白,为深入了解FAdV-4贵州株Fiber2基因的遗传变异情况,本研究利用PCR技术扩增FAdV-4贵州晴隆株(GZ-QL)Fiber2基因,胶回收后将其连接至pMD19-T载体,转化入DH5α筛选阳性克隆质粒,经质粒PCR及双酶切鉴定后进行DNA测序,然后对测序结果进行生物信息学分析.结果显示,GZ-QL株Fiber2基因全长为1440 bp,与四川分离的SCnj1601强毒株、北京分离的NIVD2强毒株Fiber2基因核苷酸同源性均为100.0%,与FAdV-4经典ON1株Fiber2基因核苷酸同源性为95.9%,两者位于相同进化分支.GZ-QL Fiber2蛋白共有33个氨基酸突变位点,其中,在第11~15位之间有5个氨基酸插入;蛋白质亲水性平均值为-0.031,其二级结构以无规则卷曲为主(占51.8%),无跨膜结构域或信号肽,抗原表位分布均匀,预测有8个优势抗原表位区域,且集中于N端.以上结果表明,FAdV-4贵州株GZ-QL Fi-ber2蛋白在禽腺病毒血清4型内相对保守且抗原性良好,具备成为优势抗原的潜力.
禽腺病毒血清4型、Fiber2基因、生物信息学分析
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Q785(基因工程(遗传工程))
贵州省科技计划项目;贵州省科技支撑计划项目;贵州省优秀青年科技人才项目
2023-02-07(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共9页
1603-1611