奶牛乳房炎链球菌GapC蛋白的生物信息学分析与重组表位疫苗设计

摘要：

为设计奶牛乳房炎链球菌GapC蛋白的多表位串联疫苗，进一步提高 GapC蛋白的免疫效果，采用DNAMAN、MEGA软件分析GapC的同源性与系统发生，结果显示，不同种类链球菌亲缘关系均较近，尤其是与奶牛乳房炎有关的链球菌亲缘关系更近。利用在线软件预测GapC为亲水性蛋白，存在多个酶切位点；采用SignalP 4.1与TMHMM Server v.2.0软件预测GapC无信号肽和跨膜结构，定位于细胞表面；SOPMA服务器预测GapC二级结构中含无规则卷曲30.36％，α-螺旋33.93％，β-转角12.50％，β-片层23.21％。采用Swiss-Model预测的GapC三级结构与二级结构相符。利用ABCpred和BepiPred方案，预测GapC存在5个B细胞表位。运用神经网络与量化矩阵法预测GapC具有1个CTL表位。使用MHC-Ⅱ类分子结合肽在线程序预测显示GapC具有1个Th表位。采用DNASTAR Protean软件重组GapC抗原表位，设计获得抗原性较好的GapC重组表位多肽。

关键词：奶牛乳房炎、链球菌、GapC蛋白、蛋白结构、细胞表位

所属期刊栏目：32

分类号：S858.23(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家大学生创新创业训练计划项目201510720556；陕西省农业科技创新与攻关项目2016NY-088；陕西省大学生创新创业训练计划项目1949；陕西理工学院大学生创新创业训练计划项目 UIRP15006。

在线出版日期：2016-10-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：824-831