江苏省及周边地区猪圆环病毒Ⅱ型（PCV2）分子流行病学调查

摘要：

为了解中国江苏省及周边地区猪圆环病毒Ⅱ型（ PCV2）的分子流行病学以及毒株的遗传变异情况，本研究运用PCR技术对来源于不同地区、不同猪场且PCV2检测为阳性的样品进行全基因组序列的扩增和测序，共获得18株PCV2全基因序列，并对所得到的毒株进行遗传变异分析。结果表明，18株毒株与国内外的参考毒株同源性为93．5％～99?7％，而ORF2核苷酸及其推导的氨基酸序列同源性分别为87．1％～99?9％和84．2％～99?6％，说明毒株存在一定程度的变异。系统进化树分析结果显示18株毒株中有5株PCV2a，7株PCV2b，6株PCV2d，其中20150429YC全长为1766 bp，与（HM038031．1 PCV2d等）参考毒株的同源性为100?0％，未发现PCV2c。同时，Cap蛋白的抗原表位和抗原性也发生了变化。说明，目前江苏省及周边地区猪群中PCV2感染较为普遍，PCV2的流行毒株以PCV2b基因型为主，PCV2d次之。

关键词：猪圆环病毒Ⅱ型、分子流行病学、遗传变异

所属期刊栏目：32

分类号：S852.65+1(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金项目31302071；公益性行业农业科研专项201303046；江苏省农业科技自主创新基金项目[CX142045]；江苏省第四期“333高层次人才培养工程”第二层次资助项目BRA2012194

在线出版日期：2016-06-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：390-398