水稻粒长基因GS3和qGL3功能标记的设计及应用

摘要：

水稻粒型是与其产量直接相关的重要性状。在前期研究证实来源于特大粒水稻TD70和籼稻品种Kasa1ath的重组自交系( RIL)群体中检测到已克隆的粒长 GS3和 qGL3基因的基础上,通过 TD70和 Kasa1ath的GS3、qGL3基因序列差异分析,设计功能标记,检测240个RILs和不同粒长的6个粳稻、9个籼稻中GS3、qGL3基因类型及其效应。结果显示：TD70和Kasa1ath中的GS3基因和qGL3基因分别在第2外显子上的编码区+165位置和第10外显子上的编码区+1092位置存在一个由碱基C到碱基A的单核苷酸替换,据此设计了四引物扩增受阻突变体系( Tetra-primer ARMS-PCR)标记,TD70的GS3和qGL3基因分别扩增为270 bp和145 bp条带及448 bp和288 bp条带,Kasa1ath的GS3、qGL3基因分别扩增为270 bp和175 bp条带及448 bp和216 bp条带；240个RILs中含有GS3-T和qGL3-T基因的株系61个,含GS3-T和qGL3-K的株系48个,含GS3-K和qGL3-T的株系17个；不同粒型基因组合的粒长存在显著差异,表现为GS3-T+qGL3-T﹥GS3-T+qGL3-K或GS3-K+qGL3-T﹥GS3-K+qGL3-K；长粒型的1个粳稻和5个籼稻品种的GS3基因表现为TD70带型,短粒型的5个粳稻和4个籼稻品种的GS3基因表现为Kasa1ath带型；所有水稻品种的qGL3基因均表现为Kasa1ath带型。表明开发的GS3和qGL3基因功能标记是有效的,可用于水稻分子标记辅助育种。

关键词：水稻、GS3基因、qGL3基因、序列差异、四引物ARMS-PCR标记

分类号：S511.2+2(禾谷类作物)

资助基金：国家自然科学基金项目31271678;江苏省农业科技自主创新基金项目CX114023;江苏省科技支撑计划项目BE2012303

在线出版日期：2015-01-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1191-1197