10.3969/j.issn.1000-4440.2014.04.022
几种雅罗鱼亚科鱼类基于mtDNA序列的亲缘关系
为探讨瓦氏雅罗鱼( DL, SHJ)、贝加尔雅罗鱼( BJ)、高体雅罗鱼( GT)、滩头雅罗鱼( TT)和珠星雅罗鱼(ZX)5个物种的亲缘关系,对6个雅罗鱼种群共计39个样本进行PCR扩增得到mtDNA 的COI、Cytb和D-loop 核苷酸序列,然后利用Clustalx1.8、Bioedit7.0等软件对序列进行比对、整合,最后选取长度分别为635 bp( COI)和1095 bp(Cytb-D-loop)的序列利用MEGA5.1、DNAsp5.0、Arlequin3.1等软件进行遗传多样性和遗传结构分析。序列分析结果显示,6个雅罗鱼种群在COI、Cytb和D-loop区段的腺嘌呤( A)+胸腺嘧啶( T)含量均高于鸟嘌呤( G)+胞嘧啶( C)含量;遗传多样性分析显示,高体雅罗鱼和珠星雅罗鱼COI基因的遗传多样性相对较低;6个种群在Cytb-D-loop区域的遗传多样性普遍较高,其中珠星雅罗鱼变异最大。遗传距离和邻接法( NJ)系统进化树分析显示,同属于瓦氏雅罗鱼的DL和SHJ群体亲缘关系最近(遗传距离为0.002和0.005),来自新疆的高体雅罗鱼和贝加尔雅罗鱼的亲缘关系最近(遗传距离为0.072和0.052),滩头雅罗鱼和珠星雅罗鱼的亲缘关系最近(遗传距离为0.045和0.170);不同种群间遗传分化指数显示,除DL和SHJ 2个瓦氏雅罗鱼地理群体未出现明显的遗传分化外,其他4个种群之间及其与瓦氏雅罗鱼2个地理群体间都存在不同程度的遗传分化;种群特异位点分析未找到能够区分瓦氏雅罗鱼DL和SHJ 2个群体的特异位点,但找到了多个能够区分5个雅罗鱼种的特异位点。
雅罗鱼亚科、线粒体DNA、遗传多样性、亲缘关系
Q311(遗传与变异)
国家高技术研究发展计划“863”计划项目2011AA100402-3;黑龙江省科技攻关项目GC12B307
2014-09-06(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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