干旱和盐碱共胁迫下玉米EST文库的构建与分析

摘要：

为了构建干旱和盐碱共胁迫的玉米cDNA文库,提取YQ7-96品系的雌雄分化期(12片真叶)的混合组织(叶、茎和花芽)总RNA,运用SMART技术构建pDNR-LIB载体的cDNA文库,随机挑选克隆进行表达序列标签(EST)序列的BlastX比对和MIPS归类分析.结果表明:表达频率10的只有1个独立基因,表达频率4以上的有17个独立基因,单拷贝基因有1 693个.在基因注释中发现了4个编码早期干旱诱导蛋白质的EST,在聚类分析后得到一个片段重叠群,命名为EDIP.重叠群与玉米、水稻的早期干旱诱导蛋白质相关基因有较高的同源性,表明在干旱和盐碱共胁迫的玉米EST数据库中,高频表达的基因较少,大部分为单拷贝基因；另外,已筛选出与干旱和盐碱共胁迫相关的玉米EST.

关键词：玉米、干旱、盐碱、共胁迫、EST

所属期刊栏目：30

分类号：S513.034(禾谷类作物)

资助基金：江苏省高校自然科学研究面上项目12KJB310009;南通市科技计划项目S2008049、BK2011015;江苏省博士后科研资助计划1201023B;南通大学校级课题2012002;南通大学博士启动基金项目03080519、03080227

在线出版日期：2014-03-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：27-30