一株鸭源H4N6亚型禽流感病毒A/duck/Shanghai/Y20/2006的全基因组序列测定及遗传演化分析

摘要：

为了解鸭源H4N6亚型禽流感病毒A/duck/Shanghai/Y20/2006( DK/SH/Y20/06)的来源、特征及其分子演化规律,进一步丰富水禽流感病毒的基因库,对该病毒8个基因片段分别进行了扩增和序列测定,利用分子生物学软件对测序结果进行序列分析,并与GenBank登录的相关病毒进行了遗传演化分析.结果表明,DK/SH/Y20/06的HA基因切割位点附近的氨基酸序列(PEKASR ↓ GLF)符合低致病力AIV的特征,其分子遗传演化关系属于欧亚分支；NA基因与A/mallard/Yanchen/2005( H4N6)在同一分支内,核苷酸序列同源性为98.3％；而PB2、PB1、NP、PA基因与目前在国内流行的H6亚型禽流感病毒关系密切；M基因与A/environment/Korea/CSM05/2004( H3N1)处于同一分支；而NS基因与A/wild duck/Korea/YS44/2004( H1N2)同源性最高.且DK/SH/Y20/06的8个基因与美洲H4N6亚型AIV分离株均不处在同一遗传进化分支上,相互之间遗传关系较远.可见,DK/SH/Y20/06可能是由H4N6、H6N2、H6N5、H3N1和H1N2等不同亚型来源的基因在鸭体内经过复杂重组演变的一株重组病毒.

关键词：鸭源禽流感病毒、H4N6亚型、全基因组序列、遗传演化分析、基因重组

所属期刊栏目：28

分类号：S858.322.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：上海市科委生物医药重大专项09DZ1906602

在线出版日期：2012-11-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：815-822