水稻OsSsr1基因的生物信息学分析、亚细胞定位及其表达模式

摘要：

为了探明盐敏感相关基因[ OsSsr1(Oryza sativa L.salt-sensitive related gene 1,GenBank登录号为NM_001065574)]的亚细胞定位及在水稻不同组织和各种逆境胁迫下的表达模式,通过生物信息学手段、洋葱表皮亚细胞定位、RiceXPro数据库和Real-time PCR对其进行研究.序列分析表明OsSsr1的开放阅读框为2004 bp,编码一个由667个氨基酸组成并含有5个跨膜区的蛋白质,该蛋白质N端含有一个信号肽；其启动子序列包含TGACG-motif、ABRE、TCA-element和W box等多个与逆境相关的顺式作用元件.GFP融合表达显示,OsSSR1蛋白质定位于细胞膜.RiceXPro数据库中数据分析表明,OsSsr1基因在水稻不同发育期的不同组织中均有表达,在叶中的表达量最高,胚中的表达量最低.Real-time PCR结果表明,OsSsr1表达水平受干旱、高温、高盐、低温、机械伤害、稻瘟病菌、MeJA和ABA的诱导上调.这些结果显示,OsSsr1基因可能在水稻胁迫反应中发挥重要作用.

关键词：水稻、OsSsr1、启动子、亚细胞定位、表达分析

所属期刊栏目：28

分类号：S511.035.3(禾谷类作物)

资助基金：国家“863”项目2008AA10Z108、2007AA10Z188;国家转基因生物新品种培育项目2009ZX08001-005B

在线出版日期：2012-11-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：697-702