森林草莓精氨酸脱羧酶基因的电子克隆与序列分析

摘要：

从森林草莓中分离精氨酸脱羧酶基因(FvADC),分析其表达模式、序列特征和进化关系。采用电子克隆结合RT-PCR分离FvADC；半定量RT-PCR检测其在盐、热、冷胁迫下的表达情况；生物信息学分析FvADC的结构与进化。结果获得FvADC cDNA全长，包括2 154 bp的编码区，RT-PCR验证编码区序列与电子克隆序列一致；FvADC基因编码的精氨酸脱羧酶与桃、苹果和海棠的同源性分别达87％、94％和83％，含信号肽，具有2个保守的氨基酸结构域：ADC家族2磷酸吡哆醛结合位点和ADC家族2标记2序列；进化分析表明森林草莓精氨酸脱羧酶与苹果、桃精氨酸脱羧酶关系最近；半定量RT-PCR证实FvADC在盐、热、冷胁迫下诱导表达。以上结果说明电子克隆能用于草莓基因的分离，而FvADC可作为逆境候选基因用于草莓遗传改良。

关键词：森林草莓、ADC基因、电子克隆、生物信息学、RT-PCR

所属期刊栏目：27

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：江苏省科技基础设施建设计划项目BM2008008；江苏省科技支撑计划项目SBE200930356

在线出版日期：2011-12-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：628-633