一株新城疫病毒分离株全基因组序列的克隆与分析

摘要：

根据GenBank上所公布的新城疫病毒(NDV)的全基因组序列,设计了10对引物,运用RT-PCR方法获取了三黄鸡新城疫病毒(SHJ00株)全基因组序列,并对其进行了比较分析.结果表明:此株三黄鸡新城疫病毒(SHJ00)的全基因组序列由15 192个碱基组成,在NP基因和P基因之间的非翻译区多了6个核苷酸ACACTC;与NDV一致,SHJ00基因由6个ORF组成,即3'-NP-P-M-F-HN-L-5';测序后拼接的F基因长1 672 bp,包含完整的开放阅读框(1 662 bp),编码553个氨基酸,F蛋白裂解位点的氨基酸顺序为112R-R-Q-K-R-F117,具有强毒株序列特性;根据NDV基因分型标准,三黄鸡新城疫病毒SHJ00株归属基因Ⅶ型新城疫病毒;F基因与国内外 NDV代表株的核苷酸同源性为 80.9%～97.7%,其中与F48E9同源性为84.3%,与 Lasota的同源性为 82.0%;测序后拼接的HN基因长为1 716 bp,编码571个氨基酸,与国内外 NDV 代表株的核苷酸同源性为 80.0%～98.1%,其中与F48E9同源性为84.5%,与 Lasota的同源性为81.4%.

关键词：新城疫病毒、全基因组、测序与分析

所属期刊栏目：24

分类号：S858.31(动物医学（兽医学）)

资助基金：江浙沪长三角农业攻关项目2005E60014

在线出版日期：2008-07-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：159-163