马铃薯DHN家族基因鉴定及干旱胁迫诱导表达分析

摘要：

马铃薯遭遇干旱胁迫时,会导致产量下降、品质降低.用生物信息学的方法,对马铃薯DHN(StDHN)基因家族进行全基因组鉴定,对其理化性质、染色体分布等进行分析,利用荧光定量的方法,对其在干旱胁迫下和不同组织中的表达模式进行分析.结果表明,StDHN基因家族共鉴定出5 个家族成员,分布于 1 号、2 号和4 号染色体上,理化性质分析表明氨基酸长度为80～243 个,分子量为8544.27～25121.94 ku,等电点(pI)的范围为5.24～7.38.StDHN蛋白的二级结构基本以无规卷曲为主,延伸链与β-转角的比例相当,仅有PG0009968 以α-螺旋为主.对马铃薯DHN基因上游 1500 bp启动子区域顺式作用元件分析发现,DHN基因受到光的调控,平均每个基因中有 10.4 个光响应元件;还受到脱落酸(PG0015495、PG0003531、PG0009968)、赤霉素(PG0003531)等激素的调控;与逆境胁迫相关的包括低温响应元件(PG0030949、PG0003531、PG0009968)、干旱响应元件(PG0030949)等;生长发育调控元件包括胚乳表达(PG0015495)、种子特异性调控(PG0003531)、分生组织表达(PG0003531、PG0009968).荧光定量结果发现,DHN基因参与干旱应答响应,也有可能参与马铃薯的生长调控.本研究为马铃薯中的耐旱候选基因研究提供参考.

关键词：全基因组、马铃薯、干旱胁迫、组织特异性、表达分析

所属期刊栏目：51

分类号：S532.03(薯类作物)

资助基金：现代农业产业技术体系;河北省张家口市基础研究;人才培养计划项目;河北省教育厅自然科学类青年项目;河北省马铃薯产业协同创新中心项目

在线出版日期：2023-08-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：58-64