高温胁迫下2个棉花品种转录组可变剪切差异分析

摘要：

棉花(Gossypium hirsutum L.)是一种重要的经济作物,是世界上第二大的天然纺织纤维来源和重要的食用油来源.棉花对生物和非生物胁迫高度敏感,尤其是高温胁迫极易影响花粉的活力和花药的开裂.为了解析棉花在高温胁迫下基因转录水平的相应变化机制,开展了热敏和耐热2个棉花品种的全长转录组响应高温胁迫处理变化的研究.通过转录本的可变剪切分析发现,2个棉花品种在高温胁迫下可变剪切的总数显著增加.热敏品种Che61-72中发现了2900个差异表达基因,并且差异基因在加热前样本(R0)和加热12 h后的样本(R12)中分别识别到了13251个和25296个可变剪切事件,其中内含子保留事件增加得最多,有3837个.耐热品种新陆早36号中发现了2437个差异表达基因,在加热前样本(T0)和加热12 h后的样本(T12)中鉴定到了11248个和13769个可变剪切事件,外显子跳跃事件变化得最大,增加了4144个.富集分析发现,2个品种的差异基因都显著富集到了光系统Ⅰ的光捕获、叶绿体类囊体膜和光合作用-天线蛋白通路中,并筛选出5个关键基因(CPB3、A0 A1 U8 IZF2、A0 A1 U8 KCA2、A0A1 U8NDW4和A0A1 U8NI70),均被注释为叶绿素a/b结合蛋白,它们参与了调控棉花光合作用动态平衡.本研究为棉花在高温胁迫的调节机制的深入研究提供了理论依据,为后续耐高温的种质改良及新品种培育提供了数据支持.

关键词：棉花、高温胁迫、全长转录组、纳米孔测序、可变剪切

所属期刊栏目：51

分类号：S562.01(经济作物)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;海南省自然科学基金项目;海南省自然科学基金项目

在线出版日期：2023-04-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

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