8种植物类甜蛋白家族基因进化及密码子特征分析

摘要：

类甜蛋白(thaumatin-like proteins,TLP)被归为病程相关蛋白第5家族,在植物防御和生长发育过程中发挥作用.使用Mega X、CodonW及EMBOSS网站在线软件,分析8种植物(莱茵衣藻、小立碗藓、拟南芥、水稻、谷子、高粱、小麦、玉米)类甜蛋白家族进化和密码子使用偏性.结果表明,植物类甜蛋白主要归为10个聚类组,其中聚类组Ⅴ、Ⅵ、Ⅶ中的TLP数目相对较多;5种禾本科作物TLP家族基因主要以G和C作为第3位密码子,密码子具有较强的偏好性,多数类甜蛋白基因ENC值较小,GC3s值分布较集中;8个最优密码子第3位均为G或C结尾,禾本科植物类甜蛋白家族基因密码子偏好G/C结尾.本研究分析了8种植物中类甜蛋白家族基因的进化特征及密码子使用偏性,为该家族基因的分子进化以及转基因应用提供了理论依据.

关键词：类甜蛋白、系统进化、密码子偏性、最优密码子

所属期刊栏目：50

分类号：S188(农业生物学)

资助基金：国家自然科学基金32060710

在线出版日期：2022-06-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：44-51