海南五指山猪TLR4基因克隆及生物信息学分析

摘要：

为获得海南五指山猪TLR4基因序列并分析其分子结构特征,以GenBank中猪的TLR4基因序列为参考序列,采用PCR技术对该基因组序列进行克隆、测序及相关生物信息学分析.结果显示,获得的五指山猪TLR4基因DNA序列长10435 bp,其中编码区全长2526 bp,共编码841个氨基酸;与GenBank中发布的普通猪的TLR4基因序列相比,存在38处突变(其中有2处突变位于编码区);与普通猪、牛、绵羊、犬、马、猕猴、人、黑猩猩、小鼠和鸡的同源性分别为99.9％ 、80.7％ 、79.9％ 、74.8％ 、74.7％ 、73.1％ 、73％ 、72.7％ 、62.5％ 、43.4％;五指山猪TLR4编码的蛋白属于分泌性蛋白和跨膜蛋白,具有亲水性,有8个糖基化修饰位点、17个丝氨酸(ser)、7个苏氨酸(Thr)及8个酪氨酸(TYR)磷酸化位点;氨基酸系统进化树分析表明,不同物种TLR4基因在进化过程中具有较高的保守性.该结果为进一步深入研究TLR4基因的功能奠定基础.

关键词：五指山猪、TLR4基因、克隆、生物信息学分析

所属期刊栏目：47

分类号：S828.1;Q785(家畜)

资助基金：国家自然科学基金31560696;海南省农业科学院农业科技创新专项CXZX201504;海南省自然科学基金20153080

在线出版日期：2019-06-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：41-46