罗氏沼虾转录组免疫相关SNP的挖掘与分析

摘要：

为了挖掘罗氏沼虾免疫相关单核苷酸多态性(SNP),采用第二代高通量测序技术,对罗氏沼虾的肝胰腺进行转录组深度测序分析.结果发现SNP位点37589个,其中转换25188个,颠换12401个.再对SNP所在的基因进行GO(gene ontology)分类和KOG注释,分别筛选到2451个有GO注释和2458个有KOG注释的SNP,并重点对4个重要免疫通路的145个免疫相关基因,筛选出129个SNP位点.相关研究结果将为进一步系统挖掘免疫相关SNP的分子遗传标记奠定基础,为罗氏沼虾疾病防控和选育抗病新品种提供科学参考.

关键词：罗氏沼虾、转录组、SNP、高通量测序技术、免疫、抗病

所属期刊栏目：47

分类号：S942.5(水产保护学)

资助基金：国家自然科学基金面上项目31570176、31872601;国家自然科学基金青年科学基金31000072

在线出版日期：2019-05-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：145-148