养殖大鲵肠道细菌多样性

摘要：

纯培养分离大鲵肠道细菌,选用细菌通用引物进行16S rRNA扩增,测序后提交序列并分析;免培养方法采用试剂盒提取肠道内容物总DNA,选用细菌通用引物对总DNA进行16S rRNA扩增,构建克隆文库,对阳性克隆进行PCR-RFLP分析,用HaeⅢ内切酶进行片段插入性验证并进行测序,构建系统发育树.纯培养获得103个菌株,分属于16个不同的可操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs),系统发育分析表明这些克隆序列分别属于变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和放线菌门(Actinobacteria).其中,变形菌门(占克隆总数87.63％)为最优势类群.免培养结果将随机挑取的105个阳性克隆归为15个OTUs,系统发育分析表明这些克隆序列分别属于变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)4个门.其中,变形菌门(占克隆总数的71.43％)为最优势类群.养殖大鲵肠道细菌多样性丰富,具有进一步开发研究的价值.

关键词：养殖大鲵、肠道细菌、纯培养、免培养、多样性

所属期刊栏目：47

分类号：S966.6(水产养殖技术)

资助基金：陕西省教育厅项目15JK1123;陕西理工大学人才引进启动项目SLGQD-8

在线出版日期：2019-03-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：146-151