杨树和柳树基因组共线性的可视化分析

摘要：

基因的共线性分析是比较基因组学中的重要研究内容.为了研究杨柳科植物的进化机制,对杨属中的毛果杨和柳属中的簸箕柳进行基因组内和基因组间的共线性分析.在对共线性分析及其作图软件的对比分析后,采用MCScanX对杨树、柳树进行基因组内、基因组间的共线性分析,再利用VGSC针对不同的基因组内和组间共线性关系进行可视化分析,从而推测杨树向柳树进化的过程,为杨柳科植物的进化与起源提供重要的依据.

关键词：共线性分析、共线性可视化、物种进化、杨属、柳属

所属期刊栏目：46

分类号：Q941+.2;S188(植物学)

资助基金：国家重点研发计划2016YFD0600101;国家重点基础研究发展计划2012CB114505;南京林业大学大学生创新训练计划2017NFUSPITP226

在线出版日期：2018-09-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：22-27