利用高通量测序法分析中国北方葡萄园土壤细菌的多样性

摘要：

采用Illumina Miseq高通量测序技术对葡萄园土壤中细菌16S rDNA(V4)区进行测序,分析不同生态区、不同品种、园区不同土层深度土壤微生物群落的多样性,比较不同生态区、不同品种和农家肥对土壤微生物群落结构的影响.结果表明,随土层深度增加,10~70 cm深度的土壤微生物种类数由多到少依次递减,处于0~10 cm地表的微生物种类相对较少,与40~50 cm土层的微生物种类数相近;河北省怀来县5个不同土层深度中,基于"门"分类单元共测得23382个分类单元,其中1384个分类单元是5层土样中共有的;5个不同深度土层的土样在门分类水平上占优势的物种有9个门,分别为变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)、浮霉菌门(Planctomycetes)、放线菌门(Actinobacteria)、绿屈挠菌门(Chloroflexi)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes),占比分别为34.9%、20.1%、13.6%、8.6%、6.5%、3.7%、2.8%、2.7%、2.5%;同一施农家肥条件下,品种对微生物种类数量的影响相对较小,不同生态地域间物种的数量差异相对稍大;施用农家肥可以明显改变生态地域对微生物种群的影响,土壤中微生物在属分类水平上有相似的群落组成.

关键词：IlluminaMiseq高通量测序、土壤、细菌、群落多样性、葡萄园

所属期刊栏目：46

分类号：S154.38+1(土壤学)

资助基金：国家科技支撑计划2011BAC11B05

在线出版日期：2018-05-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：48-52