家蚕SOCS-2基因的克隆与序列分析

摘要：

SOCS基因是JAK/STAT信号通路的负调节基因.为了了解家蚕SOCS基因(BmSOCS)的遗传变异与进化,通过电子克隆获得了SOCS cDNA基因序列,结果显示家蚕基因组中至少存在4种BmSOCS基因,BmSOCS -2基因存在可变剪接.通过RT - PCR从家蚕中扩增得到1个BmSOCS -2基因(BmSOCS - 2A),测序结果表明,该792 bp片段含有完整的ORF,由4个外显子组成,编码263个氨基酸残基,分子量为28.8 ku.结构分析显示,BmSOCS - 2A有5个α螺旋结构,存在典型的SH2结构域和SOCS结构域.基因芯片数据分析显示,BmSOCS -2在家蚕雌雄性腺组织中表达量最高.进化分析表明,SOCS以不同种类聚类在一起,表明各种SOCS基因家族在各昆虫物种形成前就已产生.

关键词：家蚕、JAK/STAT信号途径、SOCS-2基因、电子克隆、序列分析

所属期刊栏目：40

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金31072085;江苏省自然科学基金BK2009117;江苏省"六大人才高峰"项目2009-D-Ag18;江苏省苏州市自然科学基金YJG0907;苏州大学重大应用研究培育资助项目Q3134991

在线出版日期：2012-04-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：14-19