桃基因组ACC合成酶基因的分离及其生物信息学分析

摘要：

根据桃(Prunus persica L.Batch)品种Hakuho中与成熟相关的ACC合成酶基因cDNA序列,设计了两对特异引物,从新白花水蜜桃基因组DNA中,利用PCR方法扩增得到两个片段,经过拼接获得了ACC合成酶基因的完整序列(GenBank accession:AY994054),并对其进行了生物信息学分析.该序列全长2496 bp,包括4个外显子和3个内含子,4个外显子共长1 479 bp.桃ACC合成酶基因编码区与蔷薇科梅(Prunus murne)和梨(Pyruscommunis)的同源性分别为98%和84%,除终止密码子外,编码492个氨基酸,其中有SLSKDMGLPGLR共12个氨基酸残基的保守区,被认为是ACC合成酶的活性中心,位于274至285氨基酸残基处.推测其酶蛋白分子量为55 kDa,pI为8.26.

关键词：桃、基因组、ACC合成酶基因、分离、生物信息学

分类号：S662.136(果树园艺)

资助基金：江苏省自然科学基金BK2001206

在线出版日期：2005-06-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：82-85