心肌梗死潜在生物标志物的生物信息学研究

摘要：

目的 基于外周血单个核细胞(PBMCs)寻找心肌梗死潜在的生物学标志物.方法 从基因表达综合(GEO)数据库中下载心肌梗死患者PBMCs的测序数据集GSE59867,基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)和差异表达基因(DEGs)探讨心肌梗死过程中的生物学变化和共同基因,并进行共同转录因子预测.通过LASSO回归分析确定关键基因,绘制受试者工作特征(ROC)曲线,评估关键基因的临床价值.通过基因集富集分析(GSEA)探讨与关键基因有关的生物学变化,并基于心肌梗死数据集GSE123342验证关键基因的表达.结果 心肌梗死过程伴随着免疫炎症反应,其中关键基因有6个,即CD163、RNASE2、HP、FAM20A、MCEMP1和FAM198B.ROC曲线分析结果显示,这些关键基因的表达对心肌梗死均有较高的诊断价值.在心肌梗死恢复过程中,这些基因的表达呈现明显下降趋势.GSEA结果显示,这些关键基因涉及的生物学改变大多与糖脂代谢、活性氧、免疫炎症等有关.结论 基于PBMCs进行分析,本研究发现CD163、RNASE2、HP、FAM20A、MCEMP1和FAM198B基因与心肌梗死有关,这可能为心肌梗死的早期诊断和梗死恢复的监测、评估与管理提供新的见解.

关键词：心肌梗死、基因表达综合数据库、外周血单个核细胞、加权基因共表达网络分析、差异表达基因、生物信息学

所属期刊栏目：27

分类号：R542.2;Q811.4(心脏、血管（循环系）疾病)

资助基金：江苏省重点研发计划项目;江苏省333人才基金

在线出版日期：2023-04-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：21-28,34