基于TCGA数据库分析AHSA1表达与肝细胞癌预后的相关性

摘要：

目的 探讨热休克90 kDa蛋白ATPase同源物1的激活因子(AHSA1)在肝细胞癌(HCC)中的表达,分析AHSA1表达水平与预后的关系.方法 利用HCCDB、GEPIA和Oncomine数据库分析AHSA1 mRNA在HCC组织及正常肝组织中的表达情况.从癌症基因组图谱(TCGA)下载HCC RNA-seq表达和临床信息,使用单变量、多变量Cox比例风险回归模型以及Kaplan-Meier图来评估AHSA1预测肝癌预后的价值.利用R软件构建基于AHSA1表达水平的列线图,绘制校准曲线评估实际生存和预测生存的一致性.通过基因本体论(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)基因集富集分析揭示与AHSA1相关的肿瘤相关生物学过程.通过TIMER2.0及GFPIA数据库分析HCC中AHSA1的表达与肿瘤免疫浸润的相关性.通过CMAP筛选出作用于AHSA1的小分子靶向药物.结果 HCC组织中AHSA1的表达水平高于正常组织,差异有统计学意义(P＜0.01).AHSA1高表达与HCC预后较差有相关性(P＜0.05),AHSA1高表达是影响HCC患者总体生存期(OS)的独立因素(HR=1.970,P＜0.001).列线图显示AHSA1基因表达与HCC风险存在相关性,其预测1、3、5年OS的曲线下面积(AUC)分别为0.721、0.711、0.725.校准图显示预测生存率曲线与实际生存率曲线具有较好的一致性.GO和KEGG富集分析显示,AHSA1可以通过介导中性粒细胞活化参与糖酵解、糖异生等生物学过程来促进肿瘤的进展.AHSA1 mRNA表达水平与B细胞、CD4+T细胞、调节性T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞的免疫浸润程度有相关性(P＜0.05).依他尼酸和布雷他汀可能是逆转AHSA1基因表达的小分子靶向药物.结论 AHSA1 mRNA可能是HCC潜在的致癌基因,AHSA1 mRNA高水平表达可能促进HCC组织中免疫浸润,并且与HCC患者预后不良相关.

关键词：肝细胞癌;热休克90 kDa蛋白ATPase同源物1的激活因子;生物信息学;免疫浸润;预后

所属期刊栏目：26

分类号：R735.7;R318.04(肿瘤学)

资助基金：江苏省淮安市科学技术局重点研发计划社会发展项目HAS2015017

在线出版日期：2022-03-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：8-17