应用生物信息学分析确定PLK4是乳腺癌的关键预后基因

摘要：

目的 应用生物信息学分析探讨Polo样激酶4(PLK4)在乳腺癌中的生物学作用、预后价值和对局部免疫微环境的影响.方法 通过Oncomine数据库挖掘PLK4在多种肿瘤中的表达水平;使用GEPIA数据库及HPA数据库检索PLK4在乳腺癌组织与正常组织中的表达差异;分别通过UALCAN数据库及TIMER数据库分析PLK4表达水平与乳腺癌患者临床特点及免疫浸润的相关性;采用K-M Plotter数据库评估PLK4在乳腺癌中的预后价值.应用Coexpedia数据库构建PLK4在乳腺癌中的共表达基因网络,并通过DAVID数据库对PLK4及其关键基因进行功能分析.结果 乳腺癌组织中,PLK4 mRNA和蛋白表达较正常乳腺组织均上调,特别是在P53突变和三阴性乳腺癌中差异更为显著(P＜0.05),且预示着更差的预后.PLK4在乳腺癌免疫微环境中与免疫细胞的表达呈正相关.筛选出PLK4的25个关键基因,即TPX2、CCNB2、CCNB1、BIRC5、CDC20和FOXM1等基因,其生物学功能主要与细胞分裂、细胞周期、细胞增殖和泛素化修饰等相关.KEGG通路富集分析表明,PLK4与P53信号通路、FoxO信号通路、MAPK信号通路和PI3 K-Akt信号通路等相关.结论 PLK4在乳腺癌组织中呈高表达可提示患者不良预后,其影响乳腺癌局部免疫微环境,在一定程度上表现为癌基因的特性,推测其可作为乳腺癌治疗疗效的预测指标,有望成为乳腺癌临床诊疗的新靶点.

关键词：乳腺癌;Polo样激酶4;生物信息学;肿瘤;基因调控

所属期刊栏目：25

分类号：R737.9;R392.11(肿瘤学)

资助基金：江苏省科技项目BE2017726

在线出版日期：2022-01-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：69-76,81