基于异构网络的标签传播算法预测药物靶点关系

摘要：

识别新的药物靶点作用关系是当前药物研究的关键,在网络标签传播算法的基础上,提出了一种融合异构网络信息的药物靶点预测策略.首先计算药物相似性和靶点相似性,并结合已知的药物靶点作用关系构建异构网络.然后充分融合药物化合物和靶蛋白信息,分别在药物相似性和靶点相似性同构网络中轮流执行改进的标签传播算法,在传播过程中通过异构网络接收另一个同构网络的信息.最后通过在四个经典数据集上测试,并与网络方法BLM-NII、NRWRH算法进行比较,结果表明用该策略可获得较高的ROC和PR曲线面积,具有较高的预测精度.

关键词：标签传播、异构网络、药物、靶点、留一法

所属期刊栏目：34

分类号：TP301(计算技术、计算机技术)

资助基金：陕西省自然科学基础研究计划资助项目支持2014JQ5193;陕西省工业科技攻关资助项目2015GY102

在线出版日期：2017-06-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1011-1013,1017