一种新的D NA序列图形表达的方法

摘要：

针对当前DNA序列图形表达模式中存在简并现象的相关问题，提出了一种新的二元符号图形表达方式。将四类碱基的编码过程看成是构成DNA序列的元素在直角坐标平面上的移动过程，以两种不同的标志符号来解决可能出现的元素重叠情况。此方案所标志的图形不存在自交现象，从而在DNA序列和图形表达之间建立了一一对应的关系。通过实例说明该方法在对无向图和有向图表达中均能有效地降低图形简并度，并引入人工代谢系统中的编码模式作为分析工具对DNA序列进行比较分析；以代谢中间物值作为参数，研究不同物种的DNA序列之间的相似性。实例分析表明，该参数能较好地表征不同物种之间的相似性程度高低，是一种简便可行的DNA序列特征的比较方法。

关键词：DNA序列图形表达、DNA序列比较、代谢编码、Metabolism图形表达、人工代谢系统

分类号：TP182(自动化基础理论)

资助基金：国家教育部高等学校博士学科点专项科研基金资助项目20110162120043;中央高校基本科研业务费资助项目2011 QNZT027

在线出版日期：2014-11-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：3221-3224