基于粗糙集的蛋白质结构分类属性筛选

摘要：

为了对蛋白质结构进行正确分类，提出了一种基于粗糙集理论的蛋白质结构分类属性筛选方法。通过多结构比对工具MAMMOTH-mult获得条件属性值，针对分辨矩阵中元素特点提出了分辨矩阵简化方法和改进的属性约简方法。实验以SCOP 1.71数据库中结构信息完整的35个家族数据集为研究对象，采用本方法得到%STRCTCORE和%LOOSECORE两个蛋白质分类属性，并通过两个属性的d1a0fa1与35个蛋白质家族、46 626家族与35个结构比对结果散点图可以看出，将这两个分类属性作为蛋白质结构分类标准，基本上可

关键词：粗糙集、分辨矩阵、属性约简、多结构比对、蛋白质结构分类

所属期刊栏目：31

分类号：TP391(计算技术、计算机技术)

资助基金：河南省教育厅科学技术研究重点项目基础研究计划资助项目13A413506;河南省教育厅科学技术研究重点项目12A520028;河南师范大学新引进博士科研启动费支持课题qd12136;河南省软科学研究计划项目112400450305

在线出版日期：2014-05-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1328-1331