基于混沌游走表示的p53家族基因的进化差异性分析

摘要：

P53家族基因和肿瘤密切相关,为研究其进化差异性,首先利用混沌游走表示的方法,将p53家族基因的CDS序列映射为平面直角坐标系中的点列.继而,利用点列的坐标值构造加权特征向量,以此对CDS序列进行数值刻画.接着,基于欧式距离对CDS序列作聚类分析,并定义组内精度和分组优度来评价聚类分析的结果.最后,结合基因分段和方差分析等方法进行深入研究,从而获得更为理想的分类效果.结果表明,p53家族基因的进化差异性主要体现在CDS序列的前三分之二段和加权特征向量的第2维和第7维上,这对研究p53家族基因序列具有重要意义.

关键词：p53家族、混沌游走表示、聚类分析、进化差异性

所属期刊栏目：34

分类号：TP391;O29(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然基金资助11271163

在线出版日期：2017-11-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：655-660