乳清酸核苷单磷酸盐脱羧动力学同位素效应的理论研究

摘要：

采用密度泛函(B3LYP)理论对乳清酸核苷单磷酸盐脱羧酶(ODCase)催化乳清酸核苷单磷酸盐(OMP)脱羧反应的动力学同位素效应进行了理论计算研究,重点讨论分析了水分子对整个催化脱羧反应的影响.本文建立了包含水分子和残基的新分子模型,并对所有分子模型进行结构全优化,获得了反应势垒.计算了N-1的15N动力学同位素效应和C-6的13C动力学同位素效应.计算结果显示:质子化水分子与羧基上的两个羰基氧原子的氢键长度对催化脱羧反应势垒有很大影响,并且计算得到的15N和13C动力学同位素效应与实验结果吻合较好.这些结果都对我们提出的乳清酸核苷单磷酸盐催化脱羧反应机理提供了有利依据.

关键词：动力学同位素效应、乳清酸核苷单磷酸脱羧酶、机理

所属期刊栏目：34

分类号：O643.1(物理化学（理论化学）、化学物理学)

资助基金：National Natural Science Foundation of China11205079;Shandong Province Natural Science FundZR2014AL016;Linyi University doctoral scientific research foundation4313019

在线出版日期：2017-05-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：239-242