10.16866/j.com.app.chem201605013
NVIDIA GPU量子化学ab initio计算性能与并行效率研究
选择Valinomycin,Bamase等8个化学、生命科学领域的典型大分子体系,基函数数目从1160至12716范围,用NVIDIA K80 GPU高性能工作站,测试和分析了基于GPU特性设计的TeraChem量子化学程序的Hartree-Fock ab initio计算性能、并行效率,并与GAMESS程序在CPU典型集群上的计算精度和效率进行对比.结果表明,TeraChem在单一K80 GPU工作站的计算速度是16节点四核CPU集群的2至17倍;当GPU计算核心数增加4倍,GPU平台计算性能还能有2.5倍增长;若正确控制计算过程参数,GPU与CPU平台计算结果的计算精度完全一致.TeraChem在K80 GPU上的卓越计算性能和表现,可让化学家在普通化学实验室而不是超级计算中心,完成大规模的非经验量子化学计算,挑战计算化学极限.
GPU、Hartree-Fock从头计算、TeraChem
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TQ015.9;TP391.9(一般性问题)
贵州省自然科学基金资助项目20082116
2016-07-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
575-581
