基于欧式距离的化合物作用靶点识别方法研究

摘要：

针对新化合物作用靶点的大规模识别问题,提出基于欧式距离的化合物作用靶点识别方法.本方法以作用于同一靶点的药物分子结构为基础,计算其分子结构描述符,并以结构描述符为基础计算药物两两之间的欧式距离,利用置信区间估计的方法估算作用于该靶点化合物间的距离上限.若新化合物与上述各药物分子之间的距离小于估算的距离上限,则判断新化合物作用于该靶点.利用已知作用关系的177个靶点、767个化合物的数据对所建立的方法进行检验,判断总正确率为70.66％,对于有活性的化合物判断正确率达到82.20％,结果证明该方法可以用于对新化合物生物活性的大规模识别,对设计活性筛选实验具有参考价值.

关键词：欧式距离、靶点识别、药物筛选

所属期刊栏目：29

分类号：R914.2(药物基础科学)

资助基金：国家自然科学基金资助项目30973946,81173568;北京化工大学中央高校基本科研业务费项目ZZ1125;中药基础与新药研究北京市重点实验室项目

在线出版日期：2013-03-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：943-946