基于复杂网络理论的产甲烷常温菌和嗜热菌的代谢网络的拓扑与模块化的研究

摘要：

近几年,复杂网络的研究正成为广泛关注的热点,代谢网络是复杂网络的一个例子.本文以产甲烷的常温古细菌Methanosarcina acetivorans(M.acetivorans)和嗜热古细菌Methanopyrus kandleri (M.kandleri)的代谢网络为对象,从拓扑参数以及模块化两方面进行比较研究.结果表明:M.acetivorans与M.kandleri的代谢网络均具有较高的模块化结构.同时发现它们模块化后的代谢网络中的Hub模块均属于氨基酸代谢和碳水化合物代谢,表明这些网络模块均具有一定的功能意义.最后将Hub模块与最紧密的k-核心网络相比较,发现它们节点完全相同,此结果表明代谢网络的最紧密k-核心网络部分也是不同网络比较的重要因素.

关键词：代谢网络、网络拓扑、网络功能、模块性

所属期刊栏目：29

分类号：TP339;Q5(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金资助项目21001053;中央高校基本科研业务费专项资金资助JUSRP11126

在线出版日期：2013-03-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：642-646