用分子对接方法研究肝素与孕激素受体相互结合模式

摘要：

用分子对接模拟软件研究了肝素与孕激素受体的相互作用.以肝素中的一糖单位作为探针对孕激素受体蛋白进行搜索,获得肝素组成单位与孕激素受体的特异性结合模式.结果发现,2-O-硫酸-a-L艾杜糖醛酸(2-O-sulfated iduronic acid,IdoA(2S)作为肝素的核心组成单糖之一,与孕激素受体的结合能力最好.分子对接结果显示IdoA(2S)深入到孕激素受体的helix2和helix 11所包围的结合口袋,与孕激素受体结合结构域关键残基Asn 719形成稳固的氢键；并与孕激素受体结合结构域的关键残基Met 909残基侧链近距离接触,揭示了IdoA(2S)可能具有的孕激素受体拮抗效应的分子作用机制.本模拟实验所建立的模型能够部分解释肝素抑制孕激素依赖性乳腺癌的现象,同时推测了其相应机理.

关键词：肝素、孕激素受体、分子对接

所属期刊栏目：29

分类号：R965.1;R914.2(药理学)

资助基金：the Fundamental Research Funds for the Central Universities of China Program JKQ2011044

在线出版日期：2013-03-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：639-641