产甲烷常温菌和嗜热菌代谢网络特征的比较研究

摘要：

以产甲烷的常温古细菌Methanosarcina aeefivorans(MAC)和嗜热古细菌Methanopyrus kandleri(MKA)的代谢网络为研究对象，分析了网络的拓扑结构与功能之间的关联性。本文利用Networkx计算了代谢网络的度、度的中心性、紧密度中心性以及介数中心性等参数值，通过比较分析发现常温古细菌MAC和嗜热古细菌MKA存在氨基酸代谢以及碳水化合物代谢保守途径，且都具有明显更高的度。结果同时表明子途径00010(糖酵解/糖异生)、00020(柠檬酸循环)、00250(丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢)是常温古细菌MAC与嗜热古细菌MKA2个生物体的重要途径。

关键词：代谢网络、古细菌、产甲烷菌

所属期刊栏目：28

分类号：TP339;Q5(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金资助项目21001053；中央高校基本科研业务费专项资金资助JUSRP11126

在线出版日期：2011-12-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：769-773