用DTW算法构建细胞色素c的进化树

摘要：

构建生物的细胞色素c的进化树对蛋白质一级结构的种属差异的研究十分重要.本文通过一维映射,将蛋白质一级序列转化为时间序列,采用DTW算法来计算2个时间序列之间的DTW距离,用以量度序列之间的相似度,给出比较蛋白质序列相似性的度最新算法,用以分析不同物种的细胞色素c蛋白一级序列的相似性,构建序列进化树,得到较好的结果.本方法较其它方法简单快速,为研究生物序列进化关系提供新的手段.

关键词：DTW距离、细胞色素c、时间序列、进化树

所属期刊栏目：28

分类号：Q71;Q92D20;Q92C40(生物大分子的结构和功能)

资助基金：辽宁省教育厅计划基金资助项目2009A125

在线出版日期：2011-09-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：317-319