重建代谢网络及其结构与功能的分析

摘要：

文中研究重建代谢网络及分析其拓扑结构与功能.首先,详细介绍用于重建代谢网络的主要数据类型以及相关数据库.然后,介绍重建和精练代谢网络的方法,及重建苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)代谢网络的工作.用代谢物图表示该网络,共830个节点,1 132条连线.最后,分析网络的拓扑结构特征,借助代谢网络"蝴蝶结"结构的特征对其予以简化,并从网络的小世界效应、节点度分布和关键代谢物3方面分析其巨强连通体.该巨强连通体的平均路径长度为8.63,节点度分布符合幂律分布,表明它是一个典型的小世界和无标度网络.同时,研究结果表明其关键代谢物均具备重要的生物学功能意义.

关键词：代谢网络、度分布、蝴蝶结、小世界

所属期刊栏目：27

分类号：TP339;Q5(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金资助项目60474030;安徽省教育厅自然科学基金资助项目KJ20098233Z,KJ20108133;池州学院引进硕士研究生资助项目XYK200809

在线出版日期：2010-10-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：591-596