几种α-葡萄糖苷酶结构与活性位点的预测和比较

摘要：

α-葡萄糖苷酶是生物体中一类非常重要的酶,在初级代谢及复合糖的生物合成与加工上具有重要作用.α-葡萄糖苷酶在自然界广泛分布,种类繁多,但目前对其分子结构和催化机制的了解还非常有限,因此预测并比较不同来源的α-葡萄糖苷酶结构的共性和个性具有重要的科学价值.本文从Swiss-Prot数据库中选取了4种典型微生物来源的α-葡萄糖苷酶,以EMBOSS和Clustal W在线工具比较了其基本参数和蛋白质序列,以Modeller软件预测了其三级结构,并用Castp服务器预测了它们的活性位点.根据其系统发育树和三维结构的相似性,这4种α-葡萄糖苷酶可分为AglA和YihQ,Bce33和Mal12 2组;构成它们活性位点pocket的氨基酸残基差异较大,但关键残基都由2个天冬氨酸、1个谷氨酸构成,而且AglA和YihQ,Bce33和Mal12的催化三联体在空间构象上几乎完全相似,表明它们的底物特异性和催化机制具有共性.为更好地理解α-葡萄糖苷酶的作用模式和研究其生物学功能提供了参考.

关键词：α-葡萄糖苷酶、结构、预测、活性位点、催化机制

所属期刊栏目：27

分类号：Q71;Q93(生物大分子的结构和功能)

资助基金：国家"863计划"项目2006AA10Z341,2008AA100801;湖南省重大科技专项2007FJ1007;长沙理工大学人才引进基金

在线出版日期：2010-10-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：577-581