ABEEM/MM-MD模拟溶剂对N7质子化嘌呤核酸和芳香胺离子反应的影响

摘要：

芳香胺离子是芳香胺致癌进程中产生的中间体,它与嘌呤核酸反应,生成芳香胺-DNA加成物,从而导致癌症的发生.在之前的理论研究中,我们发现,N7质子化的嘌呤与芳香胺离子反应时,过渡态的气相和液相中激发能差别很大,其具体原因还不清楚.因此,本文中,应用ABEEM/MM-MD分子动力学模拟方法,研究了溶剂对这类反应的影响.在具体的溶剂模拟中,我们使用显含的水分子作为溶剂,模拟得到了整个反应过程中N7质子化嘌呤与芳香胺离子的水的径向分布函数.分析这些结果可以发现,当反应进行到有过渡态出现时,水溶剂与过渡态的相互作用会变的比反应初始阶段强得多.从这个结果,可以得到过渡态的激发能在气相和液相中差别很大的原因是,在液相反应中,水溶剂与过渡态比较强的相互作用降低了过渡态的激发能.此外,我们也使用ABEEM方法得到了所研究反应过程中的电荷变化情况.

关键词：ABEEM/MM-MD、芳香胺离子、溶剂影响、径向分布函数、电荷

所属期刊栏目：27

分类号：O641;TQ015.9;O6-39(物理化学（理论化学）、化学物理学)

资助基金：山西省青年基金和山西省自然科学基金资助2008011042-3

在线出版日期：2010-10-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：443-446